發動機冷卻水應能避免在冷卻系中形成水垢。通常所用的冷卻水均含有鈣鎂鐵等礦物鹽類，（碳酸鹽、氯化鹽、硫酸鹽、硅酸鹽等），這些鹽類在常溫下以液態溶于水中，當發動機溫度升高，水吸熱蒸發，鹽類濃度逐漸增加，當達到飽和狀態時，它們就從水中析出，并沉積在冷卻系統的孔道和管壁上，這些沉積物稱為水垢。水垢質的堅硬，對金屬的粘附力很強。水垢不僅占據水套空間，減少冷卻水容量，影響水循環，而且水垢的導熱性很差，只有鋼鐵的1/8～1/500，積附在冷卻水道內容易造成堵塞或水垢過厚，氣缸壁的熱量不能很好地傳出去，使發動機過熱、功率下降、油耗增加、機油變稀、潤滑不良加劇零件的磨損，縮短機器的使用壽命。

冷卻水必須采用清潔的軟水。軟水指開水或經過沉淀的雨水、雪水。當無天然軟水，而只能用硬水（井水、泉水和海水）時，必須對硬水進行軟化處理使之變成軟水后方可使用。軟化硬水的方法：把水燒開，使其形成碳酸鎂或碳酸鈣，然后沉淀除去，此法最簡單、經濟。

一定要保證冷卻水溫的正常，正常水溫應在75～95℃之間，單缸蒸發式柴油機冷卻水可達100℃。水溫過高或過低都直接影響著發動機油耗、功率等，從而破壞了發動機的可靠性和經濟性。還應注意機車起動后，不能立刻開動，要使轉速逐漸增加進行預熱，水溫達45℃以上方可開動，冬季不能先起動，后加水；應避免發動機在高溫下猛加冷水或冬天停車立刻放水，以防激壞缸蓋和機體等零部件。對于使用過的冷卻水，不應經常更換，因為這種水在使用中所含鹽類逐漸沉淀而減少，水被逐漸軟化，在冬季需放水時，將水放到容器中，以便下次再用。

冷卻水使用軟水，雖然可大大減少水垢的生成，但還是不能完全根除，所以發動機累計工作1000小時以后或水垢厚達1～1.5毫米時，應及時清除，清除水垢后，可提高發動機功率和燃料經濟指標4%。

由于冷卻水套形狀復雜，故水垢只能用化學方法清除，通過酸堿的作用，使水垢由不溶解物變成可溶解物。單缸蒸發式柴油機系列，可用兩段老絲瓜去皮、籽，清洗干凈后，放入水箱里，并定期更換，即可預防和除去水垢。

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