在亞洲和美國廣泛種植的轉基因作物，使歐盟產生了分歧，英國支持種植，法國和德國則表示反對。德國計劃在全國范圍內禁止轉基因作物的種植。

據路透社8月24日報道，德國農業部正在就這一問題，征求各州政府的意見。德國聯邦食品和農業部部長克里斯蒂安·施密特要求各州政府在9月11日前對這一問題表明態度。

2015年3月，歐盟理事會通過一項法規，允許各歐盟成員國根據各自的情況，禁止或限制在本國國境內種植某一轉基因作物。

也就是說，即使一種轉基因作物在歐盟“層面上”被認定是安全的、被批準種植，但各歐盟成員國仍可以有自己的選擇，這被稱為“選擇退出”權（opt-out right）。

根據這一法規，各歐盟成員國需要在10月3日前向歐盟委員會表明自己的態度。路透社稱，施密特在發給各州政府的郵件中透露了這一信息。

目前，歐盟獲準種植的轉基因作物僅有一種，系美國孟山都公司研發的mon810轉基因玉米。這種玉米基因組中含有外源基因，能夠產生名為bt的蛋白，bt蛋白能殺死農業害蟲玉米螟，從而減少農藥的使用。

據歐盟統計，該轉基因玉米在西班牙和葡萄牙有大面積種植。

但2014年3月15日，法國農業部公布一項決議稱，鑒于有出版物提出新的科學依據表明mon810轉基因玉米會對環境產生危害，且歐盟委員會并未針對法國提交的申請停止批準種植mon810轉基因玉米的意見書采取必要措施，隨著播種期臨近，法國農業部決定禁止在法國境內銷售、使用和種植該轉基因玉米種子。

據新華網報道， 除法國外，奧地利、保加利亞、波蘭、德國、盧森堡、希臘、匈牙利和意大利也曾禁止種植mon810轉基因玉米。

此外，2014年10月，20多位歐洲頂尖植物學家聯署了一份聯名信稱，在大多數歐洲國家，轉基因作物被禁止進行田間試驗，這不是科學原因，而是政治原因。如果仍不允許發展轉基因作物，歐洲農業的發展目標將遙遙無期。

但前述法規僅涉及轉基因作物種植，而不涉及轉基因產品的自由流通和進口，也不涉及轉基因研究。

歐盟境內目前有超過58種轉基因作物用于生產食品或飼料，主要源自進口。

2015年5月，歐盟委員會批準17種新的轉基因產品在歐盟上市，這些產品包括新的玉米、大豆、油菜、棉花等，以及兩種鮮花。這是自2013年11月以來，歐盟首次放行轉基因產品。

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