無公害農產品、綠色食品和有機食品都屬于農產品質量安全范疇，都是農產品質量安全認證體系的重要組成部分；無公害農產品是綠色食品和有機食品發展的基礎，而綠色食品和有機食品是在無公害農產品基礎上的進一步提高。

無公害農產品質量水平是保障基本消費安全，滿足的是大眾消費，是最基本的市場準入條件，采用產地認定和產品認證相結合的方式，完全采取政府推動的方式發展起來。

綠色食品是在整體上達到發達國家質量安全水平，滿足人們對食品質量安全更高的需求，已成為代表我國農產品精品形象的國家品牌，推行質量認證與證明商標管理相結合的認證管理模式，以政府推動和市場運作相結合的方式發展。

有機食品強調有機農業的生產過程，是國際上比較通行的一個概念，提倡人與自然和諧共處的理念，采取市場化運作方式發展。

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