1、負責農產品衛(wèi)生監(jiān)督管理的是國家農業(yè)衛(wèi)生服務局（senasa）。該局是農業(yè)部下屬的公共機構，具有技術、管理、經濟、財政獨立權，是秘魯在農業(yè)衛(wèi)生方面的官方和權威機構。該局有一套動植物衛(wèi)生監(jiān)督體系，可以保護國家免遭非本國病蟲和疾病的侵害。同時，還有對進口動植物疾病的檢驗檢疫體系。

2、負責水產品衛(wèi)生監(jiān)督管理的機構是秘魯漁業(yè)技術局（itp），該所是隸屬于國家公共部門的行政機構。該所的主要任務是探索利用漁業(yè)資源的最佳方式、指導高附加值產品的開發(fā)，提高漁業(yè)和水產業(yè)活動的健康衛(wèi)生條件。

3、負責食品安全監(jiān)督管理的政府部門為秘魯衛(wèi)生部下屬的環(huán)境衛(wèi)生司（digesa）。該司負責食品安全等方面的管理和指導。該司下設四個處，分別是基礎衛(wèi)生處、生態(tài)和環(huán)境保護處、食品衛(wèi)生和動物傳染病處和職業(yè)健康處。

食品衛(wèi)生和動物傳染病處業(yè)務主要是在食品、飲料和對動物傳染病的預防的衛(wèi)生技術層面上進行指導規(guī)范，并監(jiān)管用于市場流通的居民消費和出口的食品和飲料的衛(wèi)生質量與無害性，以預防通過食品和動物傳染的疾病以及保護人的健康。其行政職能主要有以下四項：（1）審核市場化食品的衛(wèi)生注冊。（2）審批食品加工工廠的衛(wèi)生許可。（3）發(fā)放衛(wèi)生證書和自由銷售證書。（4）對市場流通食品進行監(jiān)督和檢舉。其中，衛(wèi)生注冊是國內或國外食品和飲料進入秘魯市場流通銷售的必要手續(xù)。衛(wèi)生監(jiān)督具體是在初級生產到終端消費整個鏈條中分析、評估、控制食品的衛(wèi)生條件。

另外，環(huán)境衛(wèi)生司下屬的全國食品衛(wèi)生規(guī)則制定委員會負責將世界貿易組織的相關食品衛(wèi)生規(guī)定當地化并加以應用。

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